Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5P7

Tdrp, Testis development-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdrpQ8C5P7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TdrpQ8C5P7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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