Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Atg16l1Q8C0J2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atg16l1Q8C0J2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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