Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctdsp2Q8BX07 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms