Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pdcl3Q8BVF2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms