Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Zfp398Q8BV16 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Zfp398Q8BV16 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms