Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ttc28Q80XJ3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ttc28Q80XJ3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ttc28Q80XJ3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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