Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Clec18aQ7TSQ1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Clec18aQ7TSQ1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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