Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc6aQ78XR0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trappc6aQ78XR0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Trappc6aQ78XR0 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Trappc6aQ78XR0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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