Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Glis3Q6XP49 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Glis3Q6XP49 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Glis3Q6XP49 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Glis3Q6XP49 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Glis3Q6XP49 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Glis3Q6XP49 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms