Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snx13Q6PHS6 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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