Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trak1Q6PD31 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms