Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bend3Q6PAL0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bend3Q6PAL0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms