Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Arhgap20Q6IFT4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Arhgap20Q6IFT4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms