Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf8Q6DID3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms