Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q6DFW0 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q6DFW0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms