Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzrn3Q69ZS0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzrn3Q69ZS0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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