Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms