Protein–RNA interactions for Protein: Q64691

Capn3, Calpain-3, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn3Q64691 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Capn3Q64691 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms