Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctr9Q62018 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctr9Q62018 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms