Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrn1Q61809 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Lrrn1Q61809 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms