Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Itga6Q61739 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms