Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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Ccne1Q61457 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccne1Q61457 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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