Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Foxd1Q61345 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Foxd1Q61345 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms