Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atf3Q60765 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atf3Q60765 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms