Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CttnQ60598 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CttnQ60598 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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