Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tnfsf15Q5UBV8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms