Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms