Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Trappc1Q5NCF2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms