Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Taf3Q5HZG4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Taf3Q5HZG4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Taf3Q5HZG4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Taf3Q5HZG4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Taf3Q5HZG4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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