Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pdp2Q504M2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms