Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ccdc185Q3V118 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc185Q3V118 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc185Q3V118 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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