Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttc9Q3V038 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttc9Q3V038 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttc9Q3V038 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttc9Q3V038 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ttc9Q3V038 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ttc9Q3V038 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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