Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prdm6Q3UZD5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prdm6Q3UZD5 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms