Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kdm5aQ3UXZ9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms