Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp30Q3UN04 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Usp30Q3UN04 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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