Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Q3U6N9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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