Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Q3U1D9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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