Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc9Q3U0M1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms