Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Srsf6Q3TWW8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms