Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gtf2f1Q3THK3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gtf2f1Q3THK3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms