Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Spatc1Q148B6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Spatc1Q148B6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms