Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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VgfQ0VGU4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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VgfQ0VGU4 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
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VgfQ0VGU4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VgfQ0VGU4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms