Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc1Q0VDN7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms