Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab42Q0PD08 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rab42Q0PD08 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms