Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cnn2Q08093 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cnn2Q08093 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms