Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
F13bQ07968 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms