Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cntn3Q07409 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms