Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AC123735.1-201ENSMUST00000227358 605 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox12Q04890 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sox12Q04890 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms