Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sox9Q04887 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms