Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Pfdn6Q03958 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pfdn6Q03958 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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